经命刘国轩等人于四月率领大军进入思明（今福建省厦门市）。
然而，耿精忠因为郑军兵马不满一万、战船不足一百为由，轻视郑军并且将之前的盟约置若罔闻。耿、郑之间于是反目成仇，十月，刘国轩在泉州涂岭击败耿精忠的部将王进。耿精忠在被清军击败后很快再次降清。刘国轩继而率军入广东。
1675年（永历二十九年、康熙十四年）五月，刘国轩率领仅仅数千饥饿无援的士兵在广东潮州的鲎母山大败数万清军，名振粤东。
1676年（永历三十年、康熙十五年）二月，刘国轩率兵入镇广东惠州，与吴三桂的势力划界而守，周旋于刘进忠与尚之信之间。[4]
1677年（永历三十一年、康熙十六年）六月，刘国轩奉命率军撤出惠州，广东的兵民夹道赠送食物欢送刘国轩的军队。[2]
进攻闽南
1678年（永历三十二年、康熙十七年）二月，郑经以刘国轩为中提督，总督诸军，并且有行事便宜之权。其受命之日，正值郑军尽丧八闽七府之地的时候。刘国轩率军出击，连战连捷，取得江东桥、祖头山等战役的胜利，攻克平和、漳平等县，进围海澄。清军闻讯后，各路援兵蜂拥而至，刘国轩采用自己所擅长的战法，在水陆之间来回作战，清军无论满汉，都因为这而变得非常疲劳。六月初十日，刘国轩终于攻破了包围长达八十三天的海澄，清守将段应举、穆黑林自缢身亡